More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2024 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
333 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  47.84 
 
 
340 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2465  glycosyl transferase family 2  47.09 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
361 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 
361 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  37.54 
 
 
2490 aa  209  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
343 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
326 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
326 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  37.88 
 
 
1252 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  37.88 
 
 
1252 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
310 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
335 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
318 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.82 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  28.41 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.78 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
727 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.09 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
1177 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
1177 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 
672 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  25.23 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
1035 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.11 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1484  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.04 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.85 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
1007 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
501 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
390 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  27.32 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  23.61 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
1739 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>