More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1054 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1054  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.1 
 
 
316 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.1 
 
 
337 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
352 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8495  glycosyl transferase family 2  39.21 
 
 
351 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
339 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
373 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 
338 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
366 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
384 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.21 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.04 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  31.13 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.63 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.39 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
623 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  35.45 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
553 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.41 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  27.14 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
597 aa  75.9  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
352 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
701 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  26.09 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  30.56 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.36 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.11 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  30.63 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.51 
 
 
1157 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  26.96 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  28.45 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  30.08 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.76 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  27.43 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  34.92 
 
 
785 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  26.72 
 
 
708 aa  68.9  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
812 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  40.57 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  24.29 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  22.48 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>