More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4200 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4200  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
317 aa  634    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.852647  normal  0.242959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2415  glycosyl transferase family 2  52.74 
 
 
293 aa  319  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0603  glycosyl transferase family 2  55.89 
 
 
282 aa  279  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  43.94 
 
 
299 aa  262  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2683  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.14 
 
 
624 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2567  glycosyl transferase family 2  43.45 
 
 
295 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8179  glycosyl transferase family 2  40.69 
 
 
299 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2991  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
300 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  25.82 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
663 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
1035 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  28.46 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.32 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  25.46 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
1250 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.92 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.94 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.37 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
727 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2017  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588171  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
337 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1547  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
317 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  21.92 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.47 
 
 
853 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.18 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.18 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.99 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.67 
 
 
853 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  22.18 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.25 
 
 
853 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.18 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  22.08 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  25.88 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  21.3 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  23.56 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
1032 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  25 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.58 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
297 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  25.54 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2212  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
600 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  27.97 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.85 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.2 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
623 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  25.51 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>