More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2991 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2991  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 300 aa  614  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2683  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2415  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8179  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0603  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4200  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.852647  normal  0.242959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 624 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2567  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.44 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  26.54 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  29.75 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  29.75 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 734 aa  65.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  22.8 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  23.86 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  29.66 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1547  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2034  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.420806  hitchhiker  0.00706431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  22 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  23.56 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 872 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  23.23 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.94 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  31.9 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  31.9 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  31.9 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  31.9 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 1074 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  31.9 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  31.9 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6302  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  22.82 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  24.75 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  30.71 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  31.86 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  21.91 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.53 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2212  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 600 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  30.91 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  22.9 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  21.61 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  24.43 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 1015 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  22.47 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 1509 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>