273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0603 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0603  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2415  glycosyl transferase family 2  53.9 
 
 
293 aa  297  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4200  glycosyl transferase family 2  55.89 
 
 
317 aa  281  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.852647  normal  0.242959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  50.38 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2683  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 
295 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.9 
 
 
624 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2567  glycosyl transferase family 2  45.52 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8179  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 
299 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2991  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
300 aa  141  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
663 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.21 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.38 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  24.89 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  26.48 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 
501 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
347 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
352 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  28.2 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
734 aa  63.5  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
361 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1547  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
326 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
287 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1975  hypothetical protein  30.65 
 
 
348 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
1067 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  22.47 
 
 
329 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  23.29 
 
 
336 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  26.15 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  22.79 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  21.4 
 
 
323 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
338 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.44 
 
 
341 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
1287 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 
373 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  26.15 
 
 
334 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
361 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0708  glycosyltransferase  34.43 
 
 
370 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0812  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
370 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  22.88 
 
 
361 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
352 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  25.42 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
1314 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
1032 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1070  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
337 aa  55.5  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0299214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
364 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.31 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.11 
 
 
377 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
373 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1970  putative glycosyl transferase (O-antigen related)  26.89 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 
353 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0672  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0579  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 
1152 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  25.91 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 
1152 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
327 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
623 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  21.7 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.93 
 
 
320 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
350 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.63 
 
 
1182 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
1009 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
632 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
812 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2791  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
277 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
988 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  22.16 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>