More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2683 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2683  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
295 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2567  glycosyl transferase family 2  52.2 
 
 
295 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  44.86 
 
 
299 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2415  glycosyl transferase family 2  44.18 
 
 
293 aa  272  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.09 
 
 
624 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0603  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 
282 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4200  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
317 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.852647  normal  0.242959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8179  glycosyl transferase family 2  38.97 
 
 
299 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2991  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
300 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 
1067 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1152 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1152 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  24.15 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  21.08 
 
 
663 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
734 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  26.23 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 
872 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
361 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  22.52 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
338 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
625 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
376 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
1509 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  27.87 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
765 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  31.43 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.13 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
623 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.97 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2017  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588171  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
2046 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
370 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
338 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  29.25 
 
 
279 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  29.25 
 
 
279 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
324 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
1275 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  26.23 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
857 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  20.49 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  23.71 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  22.27 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
832 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  22.65 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
970 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
501 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  30.16 
 
 
338 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  23.56 
 
 
746 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  21.05 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
1035 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
319 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  22.41 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  24.6 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
704 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
338 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
280 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
280 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  21.8 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
958 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  20.24 
 
 
1334 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
329 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1594  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
389 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
329 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  25.11 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
996 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
632 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>