More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0248 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0248  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  858    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766226  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  28.89 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.85 
 
 		 1833 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.76 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.95 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.98 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.73 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.73 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.5 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.65 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.5 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.71 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.73 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  21.68 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  20.86 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  24.66 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.56 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  22.41 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.44 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.26 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  23.82 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  26.61 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.16 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  24.13 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  21.2 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.88 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  25.4 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.93 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  21.93 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  24.13 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.33 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  22.63 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  24.6 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  22.35 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  23.59 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  23.59 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  23.88 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  22.82 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  25.68 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2492  putative ABC transporter, permease protein  18.28 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.214398  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  24.1 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>