72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4239 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  501  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  32.77 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  37.29 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  32.77 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  35.29 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  34.45 
 
 		 233 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  32.03 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  31.6 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  34.03 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  32.22 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  34.67 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  31.8 
 
 		 341 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  29.83 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  32.27 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  29.54 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  27.85 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  31.3 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  30.15 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  27.31 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.460731 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  26.21 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  26.67 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  32.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.52 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  24.49 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  25 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  23.56 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.56 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  32.32 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.88 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  24.11 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  22.6 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.52 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.72 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.8 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  37.21 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.08 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06301  glutathione S-transferase  30.17 
 
 		 412 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  27.67 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  32.94 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  33.72 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1994  glutathione S-transferase-like  28.57 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.67 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  26.98 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  38.71 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  38.71 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  32.31 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  30.3 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  22.86 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  31.03 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  33.73 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  30.86 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  32.91 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  26.43 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  38.71 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.65 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 205 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  22.95 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2400  Glutathione S-transferase domain protein  22.87 
 
 		 205 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  44.44 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  34.92 
 
 		 227 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 215 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  26.67 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0002  fused glutaredoxin-like domain/phycoerythrin related domain-containing protein  37.31 
 
 		 413 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>