31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3550 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  55.36 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  44.21 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  42.92 
 
 
257 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  36.32 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  34.03 
 
 
239 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  37.44 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  36.24 
 
 
246 aa  131  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  34.96 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  32.77 
 
 
252 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  33.19 
 
 
241 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  32.74 
 
 
241 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  31 
 
 
210 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  26.87 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  28.7 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  29.6 
 
 
341 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  28.97 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  27.62 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  28.86 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.33 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.81 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00070  expressed protein  42.37 
 
 
408 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.81 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.55 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  23.11 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  24.55 
 
 
263 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04050  elongation factor 1-gamma (ef-1-gamma), putative  30.88 
 
 
419 aa  42.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.4 
 
 
203 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  24.89 
 
 
263 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  24.89 
 
 
263 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>