24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3123 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  71.05 
 
 
341 aa  345  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  58.95 
 
 
232 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  59.83 
 
 
236 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  49.25 
 
 
210 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  32.74 
 
 
246 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  35.17 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  33.91 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  30.15 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  28.64 
 
 
234 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  29.39 
 
 
241 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  29.39 
 
 
241 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  28.11 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  28.57 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  28.97 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  26.32 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  27.81 
 
 
269 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  30.15 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  24.64 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  22.71 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  27.98 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  37.14 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  34.85 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  26.98 
 
 
311 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>