20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2993 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  30.74 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  30.25 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  30.45 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  32.48 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  27.31 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  32.91 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  27.71 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  28.04 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  28.86 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  25.12 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  24.23 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  25 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  25.7 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  26.05 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  24.1 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  23.59 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  22.71 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  24.1 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  28.16 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>