35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4304 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  96.27 
 
 
241 aa  440  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  38.98 
 
 
234 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  32.03 
 
 
239 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  36.4 
 
 
246 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  35.35 
 
 
246 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  36.12 
 
 
233 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  35.68 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  33.04 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  34.43 
 
 
252 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  33.92 
 
 
341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  36.65 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  32.74 
 
 
241 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  31.58 
 
 
236 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  31.7 
 
 
232 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  29.39 
 
 
229 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  34.38 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  28.84 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  29.76 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  28.57 
 
 
360 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  25.7 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  25 
 
 
362 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.63 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.74 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  33.7 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  22.93 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  26.98 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  23.62 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.74 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  23.04 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  28.64 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.1 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.18 
 
 
209 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  31.43 
 
 
214 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.11 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>