29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  94.42 
 
 
233 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  40.61 
 
 
246 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  37.77 
 
 
257 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  35.47 
 
 
234 aa  158  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  34.45 
 
 
239 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  36.48 
 
 
246 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  34.33 
 
 
242 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  34.96 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  36.12 
 
 
241 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  35.68 
 
 
241 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  33.05 
 
 
232 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  32.19 
 
 
236 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  33.84 
 
 
210 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  31.72 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  33.91 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  32.33 
 
 
252 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  26.97 
 
 
269 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  32.91 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.460731 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  28.88 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26295  predicted protein  25.78 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186392  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  22.27 
 
 
311 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.56 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06211  glutathione S-transferase  33.82 
 
 
413 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385137  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0002  fused glutaredoxin-like domain/phycoerythrin related domain-containing protein  33.82 
 
 
413 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  23.41 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06301  glutathione S-transferase  30.19 
 
 
412 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00070  expressed protein  30.08 
 
 
408 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0888  hypothetical protein  29.41 
 
 
415 aa  42  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>