37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0002 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0002  fused glutaredoxin-like domain/phycoerythrin related domain-containing protein  100 
 
 
413 aa  860    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06211  glutathione S-transferase  97.09 
 
 
413 aa  840    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385137  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18071  glutathione S-transferase  57.07 
 
 
417 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0908207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05701  glutathione S-transferase  56.62 
 
 
412 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.830033  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0975  hypothetical protein  53.09 
 
 
420 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06301  glutathione S-transferase  49.02 
 
 
412 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0888  hypothetical protein  52.35 
 
 
415 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0566  glutathione S-transferase  48.53 
 
 
408 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06221  glutathione S-transferase  48.16 
 
 
411 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2181  glutathione S-transferase  50.37 
 
 
401 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.682429  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2133  putative glutathione S-transferase  50.12 
 
 
401 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0771  hypothetical protein  50.99 
 
 
404 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.383596  normal  0.439513 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05921  glutathione S-transferase  48.03 
 
 
409 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4049  Glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 
398 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988877 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4835  predicted protein  34.65 
 
 
350 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.037505  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40218  predicted protein  35.39 
 
 
402 aa  186  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46880  predicted protein  36.63 
 
 
576 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.68572  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35579  predicted protein  30.86 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  23.5 
 
 
427 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5006  glutathione S-transferase-like protein  28.63 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061879  normal  0.748916 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  26.06 
 
 
234 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0502  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.71 
 
 
237 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  23.04 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10695  glutathione transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11770)  25.98 
 
 
289 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09299  glutathione transferase (Eurofung)  32.53 
 
 
237 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018125  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  21.76 
 
 
236 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  20.8 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02380  expressed protein  36 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  25.69 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 
238 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.78 
 
 
214 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  24.04 
 
 
224 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  24.23 
 
 
221 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  23.04 
 
 
203 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04905  Putative uncharacterized proteinTheta class glutathione S-transferase ;(EC 2.5.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJZ8]  29.69 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0318236  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.29 
 
 
214 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  21.29 
 
 
214 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>