24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1256 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
246 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  75.64 
 
 
257 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  46.15 
 
 
242 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  44.21 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  32.77 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  33.19 
 
 
234 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  34.8 
 
 
246 aa  154  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  36.48 
 
 
233 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  36.48 
 
 
233 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  36.14 
 
 
252 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  36.84 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  36.4 
 
 
241 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  27.35 
 
 
341 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  27.71 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  31.97 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  28.21 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  25.22 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  27.71 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26295  predicted protein  26.19 
 
 
360 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186392  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  24.77 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.11 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  23.58 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>