32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1137 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  75.64 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  44.87 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  42.92 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  35.74 
 
 		 234 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  32.77 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  38.2 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  34.63 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  37.77 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  35.37 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  33.04 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  33.04 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  33.33 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  28.36 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  26.96 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  27.66 
 
 		 232 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  26.07 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  28.11 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  30.25 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  25.43 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  27.41 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  24.34 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.75 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.49 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  22.67 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  23.51 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  23.93 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  23.89 
 
 		 203 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.37 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  22.62 
 
 		 315 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>