26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7102 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  55.36 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  46.15 
 
 
246 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  44.87 
 
 
257 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  34.62 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  34.76 
 
 
233 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  34.33 
 
 
233 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  34.7 
 
 
246 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  29.83 
 
 
239 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  30.31 
 
 
252 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  30.36 
 
 
341 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  30.74 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  29.72 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  27.49 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  26.43 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  26.32 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  27.7 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  27.73 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  26.41 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  28.12 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  39.39 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.75 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  25.7 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  25.7 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
207 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>