22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0107 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  37.29 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  38.64 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  40.61 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  40.17 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  34.63 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  34.8 
 
 		 246 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  36.24 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  34.88 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  35.35 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  34.7 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  34.98 
 
 		 341 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  31.88 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  33.66 
 
 		 210 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  32.74 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  35.35 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  33.62 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  35.38 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  30.45 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00070  expressed protein  24.51 
 
 		 408 aa  53.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26295  predicted protein  24.32 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186392  normal  0.178752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>