30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3678 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  710    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  71.05 
 
 		 229 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  60.7 
 
 		 232 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  60.7 
 
 		 236 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  51.24 
 
 		 210 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  31.8 
 
 		 239 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  34.98 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  33.48 
 
 		 241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  33.48 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  32.16 
 
 		 233 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  31.72 
 
 		 233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  28.63 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  27.35 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  26.96 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  30.36 
 
 		 242 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  29.6 
 
 		 241 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1720  hypothetical protein  51.32 
 
 		 84 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.505206  normal  0.16004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  28.91 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  28 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0649  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4420  hypothetical protein  53.49 
 
 		 115 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3945  hypothetical protein  53.49 
 
 		 104 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4313  hypothetical protein  53.49 
 
 		 109 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  24.1 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.460731 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  28.69 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4957  hypothetical protein  41.46 
 
 		 92 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043815  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 		 214 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 		 214 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  31.9 
 
 		 214 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  31.9 
 
 		 214 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>