40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1001 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  96.27 
 
 
241 aa  440  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  38.56 
 
 
234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4239  hypothetical protein  31.6 
 
 
239 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1256  putative glutathione S-transferase  36.84 
 
 
246 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0107  hypothetical protein  34.88 
 
 
246 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14140  hypothetical protein  35.68 
 
 
233 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013564  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  36.12 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  33.04 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3131  putative glutathione S-transferase  34.84 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3678  hypothetical protein  33.92 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2392  hypothetical protein  37.17 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373147  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3550  putative glutathione S-transferase  33.19 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3103  hypothetical protein  33.64 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321838  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6732  hypothetical protein  31.58 
 
 
236 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3123  hypothetical protein  29.39 
 
 
229 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2728  putative glutathione S-transferase  34.21 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7102  hypothetical protein  31.02 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  30.3 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00815  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14380)  30.73 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  26.27 
 
 
362 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2993  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.460731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  28.04 
 
 
203 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.74 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.63 
 
 
214 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  28.64 
 
 
264 aa  45.4  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  23.62 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  23.3 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  41.54 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  25.63 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  23.04 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  35.37 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  26.25 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  32.61 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  27.11 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.62 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  31.71 
 
 
217 aa  42.4  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  24.34 
 
 
203 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>