24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3336 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  100 
 
 		 362 aa  754    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  43.56 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0547  glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0471941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2406  hypothetical protein  29.22 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.309302  hitchhiker  0.000427749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  28.53 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7133  hypothetical protein  34.12 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2781  hypothetical protein  28.37 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2398  glutathione S-transferase-like protein  24.57 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.416741  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1126  hypothetical protein  26.43 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  26.27 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  25.77 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  25 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  22.66 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  24.14 
 
 		 263 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.47 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.14 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  25.66 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  25.66 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  25.88 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  25.64 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.94 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  23.77 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.73 
 
 		 225 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  23.87 
 
 		 315 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>