22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0485 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  100 
 
 		 368 aa  742    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0547  glutathione S-transferase  47.98 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0471941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  43.56 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7133  hypothetical protein  36.86 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  30.54 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2398  glutathione S-transferase-like protein  28.62 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.416741  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1126  hypothetical protein  30.77 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2781  hypothetical protein  32.65 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2406  hypothetical protein  27.12 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.309302  hitchhiker  0.000427749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  26.75 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  26.75 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  28.64 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  27.52 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  27.73 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  28.45 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  23.9 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  23.9 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.62 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  25.45 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  24.27 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  24.65 
 
 		 239 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  23.5 
 
 		 263 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>