56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2004 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  99.35 
 
 
308 aa  627  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  79.28 
 
 
318 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  67.53 
 
 
313 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  64.72 
 
 
312 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  63.16 
 
 
315 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  61.41 
 
 
312 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  48.73 
 
 
318 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  49.36 
 
 
318 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  48.73 
 
 
318 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  46.33 
 
 
310 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  46.43 
 
 
311 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  46.75 
 
 
311 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  45.19 
 
 
311 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  46.43 
 
 
311 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  44.37 
 
 
310 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  44.37 
 
 
310 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  46.43 
 
 
311 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  42.81 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  36.22 
 
 
310 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  25.53 
 
 
239 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  24.47 
 
 
239 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.87 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  26.75 
 
 
368 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.46 
 
 
263 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  25.49 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  27.27 
 
 
241 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  26.29 
 
 
241 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  24.15 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.72 
 
 
225 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  24.19 
 
 
241 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.19 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  24.55 
 
 
221 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  29.06 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  26.51 
 
 
222 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  25.66 
 
 
362 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  22.89 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  22.37 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.29 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  26.23 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  22.45 
 
 
263 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0547  glutathione S-transferase  25.86 
 
 
371 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0471941 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  27.42 
 
 
219 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  24.66 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.29 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  21.83 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  21.83 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2019  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.02 
 
 
262 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5691  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.06 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  24.16 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  28.85 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  22.91 
 
 
221 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  25.12 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  25.91 
 
 
220 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>