23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2781 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2781  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  727    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1126  hypothetical protein  35.34 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7133  hypothetical protein  32.26 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2398  glutathione S-transferase-like protein  29.05 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.416741  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  32.74 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  29.63 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  28.37 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0547  glutathione S-transferase  29.58 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0471941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2406  hypothetical protein  26.9 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.309302  hitchhiker  0.000427749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  38.38 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  23.92 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  23.44 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  34.31 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  34.31 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  29.13 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  23.44 
 
 		 241 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  25.48 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  27.54 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  26.57 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  26.57 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  28.97 
 
 		 204 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  28.08 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>