37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1438 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 		 318 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  93.08 
 
 		 318 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  85.53 
 
 		 318 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  50.48 
 
 		 313 aa  315  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  51.59 
 
 		 310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  50.95 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  51.28 
 
 		 310 aa  301  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  47.91 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  48.56 
 
 		 312 aa  298  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  48.87 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  46.95 
 
 		 311 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  48.57 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  49.36 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  49.36 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  49.67 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  46.01 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  46.33 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  46.65 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  47.59 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  39.17 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  30.5 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  27.36 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  28.93 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  28.93 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  28.65 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  26.5 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  30.54 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  25.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  29.36 
 
 		 236 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  29 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  31.68 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2019  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  24.68 
 
 		 219 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.37 
 
 		 221 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  24.89 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>