33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1263 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  633    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  89.35 
 
 		 310 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  73.31 
 
 		 311 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  72.03 
 
 		 311 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  71.38 
 
 		 311 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  71.38 
 
 		 311 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  63.34 
 
 		 311 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  48.05 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  46.33 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  49.52 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  46.93 
 
 		 312 aa  278  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  45.69 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  44.77 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  46.01 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  44.95 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  44.69 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  44.37 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  41.94 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  44.84 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  37.82 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  28.61 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  26.94 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  31.19 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  29.7 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  26.63 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  30.71 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.74 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  25.98 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  32.32 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  24.15 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  24.15 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.38 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2019  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>