50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1783 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  100 
 
 
310 aa  626  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  51.59 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  51.59 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  50.49 
 
 
313 aa  298  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  50.16 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  51.9 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  49.84 
 
 
311 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  51.6 
 
 
310 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  49.35 
 
 
311 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  46.6 
 
 
310 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  49.52 
 
 
310 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  49.04 
 
 
312 aa  278  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  48.7 
 
 
315 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  47.37 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  48.23 
 
 
311 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  46.65 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  48.06 
 
 
312 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  46.33 
 
 
308 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  44.97 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  40.13 
 
 
310 aa  225  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 
341 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  27.88 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.48 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  27.27 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  23.67 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  23.67 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  28.86 
 
 
239 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  27.69 
 
 
241 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  27.36 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  33.91 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  28.32 
 
 
213 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  26.63 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  23.61 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  23.67 
 
 
241 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2019  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.46 
 
 
225 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  26.9 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  25.27 
 
 
221 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  25.91 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  25 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
225 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.33 
 
 
222 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  25 
 
 
241 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  28.65 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  25.23 
 
 
215 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  22.71 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  23.56 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  24.23 
 
 
221 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  28.38 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  31.68 
 
 
223 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>