16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2406 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2406  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.309302  hitchhiker  0.000427749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  29.22 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0547  glutathione S-transferase  26.76 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0471941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  27.12 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  26.72 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2398  glutathione S-transferase-like protein  22.16 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.416741  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7133  hypothetical protein  28.64 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1126  hypothetical protein  24.6 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2781  hypothetical protein  27.44 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.91 
 
 		 202 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.53 
 
 		 263 aa  46.2  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  25.53 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  24.18 
 
 		 264 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  25.13 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  25.13 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  35.23 
 
 		 197 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>