63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2398 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2398  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 408 aa  849    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.416741  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7133  hypothetical protein  30.12 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  28.62 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2781  hypothetical protein  29.05 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1126  hypothetical protein  24.85 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0547  glutathione S-transferase  24.31 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0471941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  24.85 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  24.57 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2406  hypothetical protein  22.16 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.309302  hitchhiker  0.000427749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  31.13 
 
 		 263 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  31.13 
 
 		 263 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  22.43 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  29.47 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  25.82 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  34.95 
 
 		 246 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  27.95 
 
 		 258 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  27.62 
 
 		 241 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  25.63 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  24.81 
 
 		 203 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  31.73 
 
 		 241 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  25 
 
 		 216 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  34.88 
 
 		 217 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  26.99 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  30.69 
 
 		 260 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  23.9 
 
 		 241 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  32.97 
 
 		 200 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  32.97 
 
 		 200 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.63 
 
 		 221 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 210 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 261 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  24.39 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  28.95 
 
 		 226 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  37.66 
 
 		 215 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  31.82 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  30.21 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.05 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.05 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  24.29 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  25.1 
 
 		 217 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  25.47 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3831  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.74 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  28.85 
 
 		 241 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  29.25 
 
 		 229 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.05 
 
 		 214 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  30.77 
 
 		 214 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  30.68 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  25.31 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3780  hypothetical protein  25.74 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.67 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  35.94 
 
 		 210 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.56 
 
 		 202 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  23.14 
 
 		 203 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  31.31 
 
 		 249 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.23 
 
 		 202 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.67 
 
 		 214 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  22.67 
 
 		 214 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  30.3 
 
 		 249 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  26.18 
 
 		 315 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.39 
 
 		 207 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>