More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1465 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  76.19 
 
 		 190 aa  305  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  71.73 
 
 		 191 aa  293  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  71.96 
 
 		 191 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  277  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  67.2 
 
 		 190 aa  276  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  66.49 
 
 		 188 aa  272  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  269  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  70.37 
 
 		 190 aa  266  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  58.51 
 
 		 199 aa  239  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  56.91 
 
 		 188 aa  233  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  56.38 
 
 		 188 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  53.68 
 
 		 190 aa  208  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  53.16 
 
 		 190 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  53.16 
 
 		 190 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  207  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  52.11 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  51.05 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  51.58 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  51.58 
 
 		 275 aa  201  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  51.58 
 
 		 253 aa  201  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  51.58 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  51.58 
 
 		 275 aa  201  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  51.05 
 
 		 190 aa  197  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  48.66 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  47.59 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  44.68 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  168  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  35.79 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  37.77 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  37.77 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  38.38 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  35.26 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  35.83 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  36.51 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  35.83 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  35.64 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  37.37 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  35.11 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  32.8 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  36.17 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  35.83 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  36.32 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  40 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  33.7 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  34.92 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  34.92 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  35.29 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  34.76 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  35.98 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  33.51 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  34.76 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  32.98 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  34.95 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  32.26 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  34.92 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  33.51 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  31.38 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  31.91 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  34.39 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  33.69 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  36.16 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  38.31 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  38.31 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  33.51 
 
 		 211 aa  111  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  33.16 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  34.76 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>