More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1536 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  71.81 
 
 		 190 aa  290  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  70.21 
 
 		 188 aa  286  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  68.62 
 
 		 191 aa  283  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  63.3 
 
 		 190 aa  275  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  64.89 
 
 		 191 aa  269  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  60.64 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  61.17 
 
 		 191 aa  251  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  56.91 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  56.38 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  57.67 
 
 		 190 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  55.85 
 
 		 199 aa  231  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  58.51 
 
 		 190 aa  231  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  56.61 
 
 		 190 aa  231  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  57.67 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  57.67 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  57.67 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  57.67 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  57.14 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  57.14 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  57.14 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  57.14 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  57.14 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  57.14 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  57.14 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  57.14 
 
 		 275 aa  228  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  57.14 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  57.14 
 
 		 275 aa  227  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  57.14 
 
 		 190 aa  227  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  57.14 
 
 		 190 aa  227  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  57.14 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  57.14 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  55.03 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  46.77 
 
 		 188 aa  184  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  45.16 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  46.77 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  46.28 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  36.7 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  37.23 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  36.36 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  36.7 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  34.57 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  34.04 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  34.57 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  35.64 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  35.83 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  34.22 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  35.83 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  35.29 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  31.52 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  33.87 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  32.98 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  32.09 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  31.38 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  31.55 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  34.55 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  32.98 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  33.7 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  33.86 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  31.91 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  31.91 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  29.95 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  34.24 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  29.79 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  37.04 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  31.22 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  33.15 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  30.85 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  34.05 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  31.89 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  31.89 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>