More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1470 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  77.25 
 
 		 191 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  76.19 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  71.58 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  71.05 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  63.3 
 
 		 188 aa  275  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  270  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  63.16 
 
 		 190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  55.85 
 
 		 199 aa  225  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  51.06 
 
 		 188 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  50 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  52.11 
 
 		 190 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  52.11 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  52.11 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  50.53 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  49.47 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  52.11 
 
 		 190 aa  205  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  50 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  50 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  50 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  50 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  49.47 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  49.47 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  49.47 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  49.47 
 
 		 275 aa  200  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  49.47 
 
 		 275 aa  200  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  52.15 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  52.15 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  50.8 
 
 		 188 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  47.37 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  50.27 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  40.96 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  37.77 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  37.57 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  37.57 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  35.29 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  36.7 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  32.62 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  37.04 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  37.97 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  34.76 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  34.76 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  34.85 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  34.76 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  37.43 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  35.29 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  32.62 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  33.86 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  34.04 
 
 		 185 aa  118  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  31.75 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  34.22 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  33.16 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  34.22 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  34.03 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  30.81 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  35.11 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  31.75 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  31.22 
 
 		 186 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  33.69 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  32.28 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  34.76 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  37.04 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  32.8 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  35.83 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  31.55 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  32.62 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  34.04 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  31.52 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  32.43 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  36.13 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  31.22 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  32.8 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>