More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2332 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  89.47 
 
 		 190 aa  354  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  86.84 
 
 		 190 aa  353  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  86.84 
 
 		 190 aa  348  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  86.84 
 
 		 190 aa  348  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  85.79 
 
 		 190 aa  343  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  82.63 
 
 		 190 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  83.68 
 
 		 253 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  83.16 
 
 		 190 aa  334  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  83.16 
 
 		 190 aa  334  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  83.16 
 
 		 190 aa  334  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  83.16 
 
 		 190 aa  334  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  83.68 
 
 		 275 aa  334  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  83.68 
 
 		 190 aa  334  5e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  83.68 
 
 		 190 aa  334  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  83.68 
 
 		 190 aa  334  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  83.68 
 
 		 275 aa  334  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  83.68 
 
 		 190 aa  334  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  83.68 
 
 		 190 aa  334  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  83.68 
 
 		 190 aa  334  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  80 
 
 		 190 aa  328  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  56.61 
 
 		 188 aa  231  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  51.85 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  51.85 
 
 		 188 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  51.32 
 
 		 188 aa  220  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  52.11 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  51.58 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  50.79 
 
 		 188 aa  207  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  51.05 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  51.05 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  50.79 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  48.42 
 
 		 190 aa  194  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  47.62 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  39.36 
 
 		 188 aa  150  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  38.83 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  38.5 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  38.5 
 
 		 188 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  38.1 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  34.92 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  34.92 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  34.92 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  35.45 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  34.39 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  34.92 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  34.92 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  34.92 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  34.39 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  34.39 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  34.39 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  34.39 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  34.39 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  34.39 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  34.39 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  35.6 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  35.98 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  33.86 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  34.03 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  32.28 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  34.57 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  31.22 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  35.79 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  31.22 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  35.98 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  34.74 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  32.8 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  30.16 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  34.92 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  30.53 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  30.16 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  34.38 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  30.69 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  33.68 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  33.86 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  30.16 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  31.22 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  32.45 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  31.91 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  30.85 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  32.63 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  33.16 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  32.98 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  31.22 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  29.79 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  33.16 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  32.28 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  31.58 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  32.8 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  30.89 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  33.69 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  29.63 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  31.91 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  31.22 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  34.55 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  32.63 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>