More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1920 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  96.84 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  89.47 
 
 		 190 aa  357  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  84.74 
 
 		 253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  84.74 
 
 		 275 aa  340  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  84.74 
 
 		 275 aa  340  7e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  84.21 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  84.21 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  84.21 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  84.21 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  84.74 
 
 		 190 aa  340  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  84.74 
 
 		 190 aa  340  9e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  84.74 
 
 		 190 aa  340  9e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  84.74 
 
 		 190 aa  340  9e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  84.74 
 
 		 190 aa  340  9e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  84.74 
 
 		 190 aa  340  9e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  83.68 
 
 		 190 aa  339  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  82.63 
 
 		 190 aa  335  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  82.63 
 
 		 190 aa  336  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  84.21 
 
 		 190 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  84.21 
 
 		 190 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  55.03 
 
 		 188 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  53.97 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  50.26 
 
 		 188 aa  209  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  49.21 
 
 		 188 aa  208  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  51.05 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  49.74 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  47.37 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  51.58 
 
 		 191 aa  194  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  49.47 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  47.09 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  46.56 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  41.49 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  40.96 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  36.7 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  36.9 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  37.57 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  37.77 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  34.39 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  32.8 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  35.6 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  32.8 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  32.8 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  34.92 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  32.28 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  32.63 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1673  elongation factor P  33.51 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0528858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  32.8 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  30.69 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  32.28 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  30.69 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  30.16 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  31.38 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  34.21 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  30.16 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  32.98 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  33.16 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  33.16 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  30.69 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  32.43 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  33.68 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  32.11 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  32.58 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  30.16 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  29.79 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  33.16 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  32.45 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  30.85 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  31.38 
 
 		 185 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  31.05 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  31.22 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  32.09 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  30.85 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  30.85 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  33.68 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  31.75 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  30.65 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  30.53 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  31.91 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  30.65 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  33.87 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>