More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1806 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  77.25 
 
 		 190 aa  311  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  71.73 
 
 		 191 aa  293  7e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  70.74 
 
 		 188 aa  290  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  68.62 
 
 		 188 aa  283  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  69.84 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  67.2 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  65.43 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  66.14 
 
 		 190 aa  259  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  60.11 
 
 		 199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  54.26 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  53.72 
 
 		 188 aa  225  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  55.79 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  55.79 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  54.21 
 
 		 190 aa  218  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  53.68 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  51.58 
 
 		 190 aa  214  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  53.68 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  52.63 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  52.63 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  52.63 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  52.63 
 
 		 275 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  52.63 
 
 		 275 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  52.63 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  207  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  51.05 
 
 		 190 aa  205  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  49.2 
 
 		 188 aa  194  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  48.39 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  48.39 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  42.55 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  44.92 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  37.23 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  35.86 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  34.57 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  36.17 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  37.66 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  34.24 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  35.11 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  34.22 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  31.58 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  34.22 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  32.8 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  32.11 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  33.16 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  32.62 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  32.62 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  32.83 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  31.38 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  32.62 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  35.71 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  32.62 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  32.26 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  35.48 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  30.37 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  31.58 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  34.76 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  30.32 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  31.35 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  28.57 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  32.28 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  29.73 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  32.28 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  31.02 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  33.9 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  33.9 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  32.28 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  32.09 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  33.69 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  33.16 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  30.11 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  31.55 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>