More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003095 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  96.81 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  76.6 
 
 		 199 aa  316  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  56.38 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  55.85 
 
 		 190 aa  234  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  56.91 
 
 		 191 aa  233  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  54.79 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  54.26 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  52.38 
 
 		 190 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  51.32 
 
 		 190 aa  220  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  51.85 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  51.06 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  51.6 
 
 		 188 aa  215  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  52.13 
 
 		 191 aa  214  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  51.85 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  51.85 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  50.79 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  50.79 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  50.79 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  50.26 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  50.26 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  50.79 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  50.26 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  50.79 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  50.26 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  50.79 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  50.79 
 
 		 253 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  50.79 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  50.79 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  50.26 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  53.19 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  49.21 
 
 		 190 aa  208  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  48.68 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  41.49 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  39.25 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  36.56 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  34.41 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  34.41 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  36.7 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  39.89 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  37.23 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  35.64 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  36.56 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  35.45 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  34.04 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  35.48 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  33.51 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  32.98 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  33.15 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  34.04 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  31.02 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  31.38 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  30.85 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  32.07 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  32.07 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  30.98 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  34.59 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  32.07 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  34.04 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  31.55 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  28.72 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  30.85 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  30.85 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  32.43 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  34.05 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  34.59 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  35.45 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  31.91 
 
 		 186 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  34.22 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  31.02 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  32.97 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  29.79 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  32.43 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  30.85 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  33.51 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  33.51 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  29.26 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  31.02 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  33.88 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>