More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0829 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  100 
 
 		 199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  76.6 
 
 		 188 aa  315  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  76.6 
 
 		 188 aa  316  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  58.51 
 
 		 191 aa  239  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  58.51 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  60.11 
 
 		 191 aa  238  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  57.14 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  57.67 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  57.67 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  55.85 
 
 		 188 aa  231  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  55.03 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  57.45 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  51.85 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  55.32 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  55.85 
 
 		 190 aa  225  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  51.78 
 
 		 253 aa  222  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  51.78 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  51.78 
 
 		 275 aa  221  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  54.5 
 
 		 190 aa  221  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  55.32 
 
 		 188 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  52.91 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  52.91 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  52.91 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  52.38 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  52.38 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  53.97 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  52.38 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  52.91 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  52.91 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  52.38 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  52.91 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  53.44 
 
 		 190 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  54.79 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  40.43 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  40.32 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  39.25 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  38.71 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  39.25 
 
 		 188 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  36.76 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  33.16 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  31.38 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  34.92 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  34.74 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  31.38 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  31.52 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  31.38 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  34.46 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  34.21 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  31.38 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  32.26 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  33.77 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  32.98 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  31.91 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  34.76 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  31.38 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  29.95 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  29.79 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  29.63 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  34.22 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  32.43 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  30.32 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  32.46 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  31.18 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  28.19 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  28.88 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  29.95 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  30.65 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  28.19 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  28.19 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  32.29 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  33.33 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  35.29 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  32.61 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  28.88 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  27.51 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  33.69 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  35.29 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  31.38 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  32.97 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  30.43 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  27.27 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  28.72 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  31.02 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  32.34 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  33.69 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>