More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1404 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  98.94 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  75 
 
 		 188 aa  308  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  74.47 
 
 		 188 aa  298  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  52.15 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  48.39 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  46.77 
 
 		 188 aa  184  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  47.31 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  48.39 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  46.77 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  44.09 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  40.86 
 
 		 190 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  39.25 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  39.89 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  38.71 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  39.04 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  38.83 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  36.02 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  40.11 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  40.11 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  34.41 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  38.5 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  36.7 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  39.36 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  38.3 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  38.3 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  38.3 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  38.3 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  38.3 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  38.3 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  38.5 
 
 		 253 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  38.5 
 
 		 275 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  38.3 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  38.3 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  38.5 
 
 		 275 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  38.3 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  38.3 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  35.48 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  35.68 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  32.28 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  35.14 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  32.97 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  34.22 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  31.55 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  32.09 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  31.35 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  38.71 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  31.55 
 
 		 211 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  34.95 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  34.05 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  30.85 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  32.8 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  34.05 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  34.41 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  31.91 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  31.58 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  30.65 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  32.43 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  33.69 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  34.59 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  32.97 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  32.97 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  30.85 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  32.98 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  34.24 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  29.95 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  34.59 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  32.43 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  32.62 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  31.02 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  31.55 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  32.45 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  31.35 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  33.7 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  32.8 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  34.74 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  31.89 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  32.61 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  32.8 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  32.43 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  31.55 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  31.02 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  34.42 
 
 		 185 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  31.35 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  32.8 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  32.8 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  32.43 
 
 		 189 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  31.58 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  28.88 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  30.98 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  30.11 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  32.09 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  39.22 
 
 		 185 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>