More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1082 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  36.84 
 
 
190 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  41.67 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  35.83 
 
 
187 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  40.21 
 
 
194 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  39.66 
 
 
185 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  39.44 
 
 
187 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  38.89 
 
 
187 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  36.46 
 
 
187 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  45.21 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  39.25 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  40.56 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  43.42 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  38.5 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  43.42 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  40.11 
 
 
185 aa  131  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  40.11 
 
 
185 aa  131  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  42.11 
 
 
189 aa  131  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  39.44 
 
 
187 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  42.76 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  38.33 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  42.76 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  36.87 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  42.76 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  43.79 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  42.48 
 
 
185 aa  128  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  39.87 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  39.11 
 
 
185 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  36.9 
 
 
185 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  38.37 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  39.05 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  34.95 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  38.37 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  40.11 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  37.43 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  37.21 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  38.46 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  37.99 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  42.11 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  41.18 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  41.83 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  40 
 
 
216 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  41.83 
 
 
185 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  41.83 
 
 
185 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  37.43 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  43.14 
 
 
185 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  37.78 
 
 
187 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  38.76 
 
 
188 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  37.21 
 
 
189 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  35.87 
 
 
187 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  36 
 
 
186 aa  124  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  43.14 
 
 
187 aa  124  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  39.43 
 
 
190 aa  124  9e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  38.37 
 
 
188 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  40.7 
 
 
187 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  37.5 
 
 
185 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  37.43 
 
 
188 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  34.22 
 
 
185 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  38.37 
 
 
189 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  35.64 
 
 
191 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  34.76 
 
 
185 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  39.33 
 
 
188 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  37.85 
 
 
188 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  35.36 
 
 
187 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  41.18 
 
 
187 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  42.48 
 
 
189 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  36.84 
 
 
188 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  35.75 
 
 
185 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  35.36 
 
 
187 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  37.21 
 
 
189 aa  121  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  41.18 
 
 
186 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  36.84 
 
 
188 aa  121  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  36.63 
 
 
188 aa  120  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  34.76 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  36.42 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  34.22 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  34.22 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  40.52 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  35.36 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  36.67 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  36.67 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  35.47 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  36.16 
 
 
188 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  36.16 
 
 
188 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  33.7 
 
 
189 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  35.83 
 
 
188 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  36.16 
 
 
188 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  32.63 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  37.91 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  38.82 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  34.5 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  39.87 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  35.83 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  33.51 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  33.15 
 
 
189 aa  118  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  33.15 
 
 
189 aa  118  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  35.91 
 
 
187 aa  118  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  36.93 
 
 
187 aa  118  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  36.26 
 
 
187 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  33.15 
 
 
189 aa  118  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>