More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0133 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0133  elongation factor P  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  54.26 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  54.79 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  54.79 
 
 		 187 aa  205  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  53.72 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  51.83 
 
 		 190 aa  201  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  51.05 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  52.36 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  54.5 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  52.91 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  51.05 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  52.66 
 
 		 188 aa  197  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  52.66 
 
 		 188 aa  197  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  51.6 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  52.08 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  51.06 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  50.53 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  49.47 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  49.47 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  49.47 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  48.94 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  50.53 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  49.47 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  51.58 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  51.09 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  50.27 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  47.89 
 
 		 191 aa  184  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  49.73 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  48.94 
 
 		 188 aa  181  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  45.95 
 
 		 188 aa  178  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  48.4 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  48.65 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  47.34 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  47.34 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  47.87 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  47.34 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  48.11 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  45.74 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  45.74 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  45.74 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  45.74 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  47.34 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  43.55 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  43.68 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  42.93 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  45.16 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  46.49 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  43.09 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  43.16 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  43.16 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  41.18 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  43.16 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  41.58 
 
 		 188 aa  164  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  41.4 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  41.62 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  41.05 
 
 		 189 aa  161  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  38.59 
 
 		 187 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  43.62 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  43.62 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  43.24 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  41.3 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  41.62 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  40.76 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  40.22 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  40.22 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  41.85 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>