More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1058 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1058  putative Cof-like hydrolase  100 
 
 		 261 aa  510  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00385652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0364  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.68 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1661  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.48 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  25.65 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  27.03 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0666  hypothetical protein  28.32 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.000742923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  23.41 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3942  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.41 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000956617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  26.64 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4172  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.27 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0575456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  27.52 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.09 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  23.64 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1066  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.09 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840959  normal  0.475939 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  23.64 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  23.64 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.84 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4133  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  25.58 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  23.26 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  25.3 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.17 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  23.26 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  26.07 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  25.3 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  26.07 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  25.3 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3819  HAD-superfamily hydrolase  27.08 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126763  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  24.4 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  25.67 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  25.3 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3804  HAD-superfamily hydrolase  26.62 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.45 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  25.3 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  25.3 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  25.3 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.97 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  27.14 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3974  HAD family hydrolase  26.62 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4285  HAD family hydrolase  26.62 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  24.61 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  22.52 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  22.52 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  22.52 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  22.52 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  24 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  28.09 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0817  HAD family hydrolase  26.46 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.72 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  28.97 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.52 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  25.58 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3893  Cof-like hydrolase  40.2 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.805334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  25.67 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  28.15 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.09 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  25.37 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  27.72 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  25.7 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  22.52 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  23.58 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0867  Cof-like hydrolase  29.09 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.546993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  27.07 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  25.95 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  27.01 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1077  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.37 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000777546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  24.02 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  26.67 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4161  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.37 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.52 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  23.39 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  25.21 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  24.19 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  25.76 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  25.1 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  23.39 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  25.86 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  25.26 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  24.51 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  25.19 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  22.02 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  25 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  24.11 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  25.27 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.14 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>