More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06740 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06740  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  100 
 
 
744 aa  1523    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.605616  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04774  siroheme synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06600)  39.12 
 
 
560 aa  340  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.307329  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31820  methionine metabolism  37.85 
 
 
574 aa  337  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.164559 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12925  predicted protein  44.49 
 
 
255 aa  198  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.48 
 
 
245 aa  160  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.65 
 
 
458 aa  157  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  39.68 
 
 
505 aa  157  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  35.8 
 
 
516 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.94 
 
 
480 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3310  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  40 
 
 
249 aa  154  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.198523  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  38.28 
 
 
422 aa  153  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.4 
 
 
245 aa  152  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.62 
 
 
491 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.6 
 
 
479 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.4 
 
 
250 aa  151  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.52 
 
 
480 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.11 
 
 
250 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.8 
 
 
272 aa  151  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.51 
 
 
245 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.26 
 
 
487 aa  150  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.78 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.9 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.08 
 
 
288 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.15 
 
 
283 aa  147  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.19 
 
 
426 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  28.14 
 
 
489 aa  147  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.5 
 
 
475 aa  146  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.05 
 
 
268 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.66 
 
 
528 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.84 
 
 
275 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.36 
 
 
248 aa  145  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.68 
 
 
277 aa  144  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.99 
 
 
271 aa  144  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  35.92 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  24.62 
 
 
457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.95 
 
 
272 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.84 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  25.61 
 
 
457 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2619  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.69 
 
 
257 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  25.61 
 
 
459 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.27 
 
 
277 aa  142  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5405  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.66 
 
 
252 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  25 
 
 
457 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.45 
 
 
250 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  25.61 
 
 
457 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  25.61 
 
 
457 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  35.34 
 
 
259 aa  141  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  24.62 
 
 
457 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.3 
 
 
259 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0853  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.27 
 
 
246 aa  141  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  24.86 
 
 
457 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  35.83 
 
 
410 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  34.75 
 
 
492 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.15 
 
 
340 aa  140  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1505  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.84 
 
 
257 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.97 
 
 
329 aa  140  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.88 
 
 
262 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  34.75 
 
 
492 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.57 
 
 
276 aa  140  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  24.44 
 
 
457 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.44 
 
 
457 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  24.44 
 
 
457 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  24.44 
 
 
457 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.3 
 
 
249 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  24.44 
 
 
457 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  24.44 
 
 
457 aa  139  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.69 
 
 
464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  25.65 
 
 
554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.07 
 
 
264 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.44 
 
 
448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.36 
 
 
405 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.36 
 
 
246 aa  138  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2610  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.32 
 
 
265 aa  138  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0897375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.18 
 
 
493 aa  138  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.69 
 
 
510 aa  138  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_4668  predicted protein  35.39 
 
 
249 aa  138  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  36.63 
 
 
513 aa  138  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.45 
 
 
266 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.4 
 
 
277 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.2 
 
 
292 aa  137  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.66 
 
 
252 aa  137  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.76 
 
 
570 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29821  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.39 
 
 
261 aa  137  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.564454 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0211  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.92 
 
 
239 aa  137  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.283358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.69 
 
 
505 aa  137  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.29 
 
 
511 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
239 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.5 
 
 
478 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2306  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.82 
 
 
351 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.500417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.46 
 
 
263 aa  136  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.34 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.11 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.59 
 
 
274 aa  136  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.94 
 
 
250 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.39 
 
 
258 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2636  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.44 
 
 
256 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2225  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.69 
 
 
279 aa  136  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00956317  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.39 
 
 
258 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.92 
 
 
246 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  25.7 
 
 
462 aa  135  3e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>