More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3310 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3310  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  100 
 
 
249 aa  471  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.198523  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0853  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.4 
 
 
246 aa  300  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.97 
 
 
248 aa  244  9e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
245 aa  234  9e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.2 
 
 
258 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.88 
 
 
271 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
249 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.49 
 
 
493 aa  208  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.03 
 
 
258 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.03 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.6 
 
 
258 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  50.84 
 
 
513 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  46.75 
 
 
505 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.03 
 
 
259 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.41 
 
 
507 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
258 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.74 
 
 
464 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
246 aa  198  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.28 
 
 
458 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  45.75 
 
 
464 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.64 
 
 
493 aa  195  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  45.75 
 
 
464 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 
258 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
463 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.54 
 
 
256 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 
252 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
464 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
463 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.2 
 
 
525 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
464 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.22 
 
 
473 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0206  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  43.39 
 
 
474 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.67 
 
 
272 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.31 
 
 
504 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
463 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.09 
 
 
462 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.53 
 
 
273 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  46.59 
 
 
465 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.72 
 
 
504 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.52 
 
 
242 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
276 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.17 
 
 
489 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  46.09 
 
 
465 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.08 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  41.7 
 
 
516 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.64 
 
 
278 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.68 
 
 
497 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 
261 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.5 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.09 
 
 
505 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.81 
 
 
273 aa  188  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
503 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.31 
 
 
510 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.1 
 
 
292 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.36 
 
 
245 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
281 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
512 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.5 
 
 
247 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.83 
 
 
269 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
281 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
278 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.02 
 
 
248 aa  186  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.511728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
482 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05583  siroheme synthase  43.51 
 
 
301 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.42 
 
 
293 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.74 
 
 
246 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.9 
 
 
511 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.86 
 
 
482 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
277 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.15 
 
 
519 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.9 
 
 
246 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.15 
 
 
479 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  45.16 
 
 
520 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001603  uroporphyrinogen-III methyltransferase  44.77 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.9 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  44.54 
 
 
457 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  40.66 
 
 
259 aa  183  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.82 
 
 
276 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2610  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.2 
 
 
265 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0897375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
276 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.58 
 
 
475 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  44.54 
 
 
457 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
480 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  44.54 
 
 
457 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.31 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  44.54 
 
 
457 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  44.54 
 
 
459 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
283 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.21 
 
 
273 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
484 aa  181  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0271  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.61 
 
 
243 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>