More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2221 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
426 aa  830    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.1 
 
 
426 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  65.19 
 
 
410 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  66.75 
 
 
448 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  66.92 
 
 
410 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.72 
 
 
405 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.07 
 
 
394 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.58 
 
 
398 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.58 
 
 
398 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.58 
 
 
398 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  56.2 
 
 
405 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.25 
 
 
411 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.92 
 
 
402 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.96 
 
 
419 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.67 
 
 
403 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.31 
 
 
414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.11 
 
 
405 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.67 
 
 
407 aa  348  8e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.93 
 
 
419 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.33 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.64 
 
 
475 aa  335  7e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.26 
 
 
418 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.07 
 
 
406 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.26 
 
 
420 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.88 
 
 
422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.15 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  42.7 
 
 
490 aa  282  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.75 
 
 
421 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
385 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.63 
 
 
403 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.5 
 
 
426 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.67 
 
 
416 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.33 
 
 
276 aa  242  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.6 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.56 
 
 
271 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  52.3 
 
 
513 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  47.28 
 
 
516 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  37.58 
 
 
472 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  47.33 
 
 
505 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.04 
 
 
480 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.37 
 
 
472 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.54 
 
 
512 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  37.37 
 
 
472 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.97 
 
 
480 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
504 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 
504 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  51.03 
 
 
520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.29 
 
 
250 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.18 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.12 
 
 
252 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  35.4 
 
 
457 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  59.57 
 
 
508 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  35.18 
 
 
457 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  35.4 
 
 
459 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  34.96 
 
 
457 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.7 
 
 
570 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  35.75 
 
 
476 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  34.96 
 
 
457 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
264 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.72 
 
 
512 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.15 
 
 
250 aa  216  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
497 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.03 
 
 
258 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.82 
 
 
553 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52 
 
 
491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.63 
 
 
258 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.7 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.15 
 
 
250 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.86 
 
 
511 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.03 
 
 
531 aa  213  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.9 
 
 
245 aa  213  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.09 
 
 
464 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.67 
 
 
503 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.25 
 
 
458 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.86 
 
 
510 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.47 
 
 
464 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.95 
 
 
470 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
258 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.29 
 
 
255 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.43 
 
 
258 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.95 
 
 
254 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  34.29 
 
 
457 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.13 
 
 
506 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.4 
 
 
473 aa  210  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.04 
 
 
507 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.49 
 
 
258 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
505 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.28 
 
 
513 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.37 
 
 
258 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
259 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.95 
 
 
272 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.23 
 
 
493 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.05 
 
 
508 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.48 
 
 
519 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.94 
 
 
258 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.94 
 
 
258 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.94 
 
 
258 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.94 
 
 
258 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.14 
 
 
489 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>