More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31820 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31820  methionine metabolism  100 
 
 
574 aa  1178    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.164559 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04774  siroheme synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06600)  45.82 
 
 
560 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.307329  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06740  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  37.85 
 
 
744 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.605616  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12925  predicted protein  44.49 
 
 
255 aa  186  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.4 
 
 
487 aa  172  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.26 
 
 
479 aa  163  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  27.91 
 
 
457 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.78 
 
 
497 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  24.8 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.8 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  24.8 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  24.8 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  24.8 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  24.8 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  24.18 
 
 
467 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  24.61 
 
 
457 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  25.05 
 
 
457 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  25.05 
 
 
457 aa  154  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  25.98 
 
 
457 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  25.98 
 
 
457 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  25.98 
 
 
459 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  25.98 
 
 
457 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.37 
 
 
480 aa  153  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.24 
 
 
528 aa  153  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.88 
 
 
554 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.11 
 
 
458 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.79 
 
 
277 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  24.4 
 
 
459 aa  151  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.86 
 
 
277 aa  151  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.99 
 
 
504 aa  151  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  25.79 
 
 
457 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.24 
 
 
482 aa  151  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.82 
 
 
245 aa  150  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.8 
 
 
491 aa  150  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  26.26 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.12 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.51 
 
 
502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.86 
 
 
292 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.4 
 
 
272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.91 
 
 
249 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  24.66 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.1 
 
 
497 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.46 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  24.25 
 
 
459 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
246 aa  146  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.03 
 
 
275 aa  146  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  33.6 
 
 
505 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0853  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.82 
 
 
246 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.9 
 
 
489 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.73 
 
 
484 aa  145  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.87 
 
 
493 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.93 
 
 
245 aa  144  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.18 
 
 
283 aa  143  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.44 
 
 
250 aa  143  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.07 
 
 
276 aa  143  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3310  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  36.74 
 
 
249 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.198523  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  35.29 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.74 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.07 
 
 
272 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.73 
 
 
490 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  23.83 
 
 
473 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.02 
 
 
511 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  23.83 
 
 
473 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.96 
 
 
250 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3091  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.89 
 
 
263 aa  140  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000546581  normal  0.020085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.5 
 
 
282 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.19 
 
 
495 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.79 
 
 
476 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.04 
 
 
422 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.4 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0708  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.52 
 
 
464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.66 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2636  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.24 
 
 
256 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.91 
 
 
266 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.78 
 
 
481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.86 
 
 
470 aa  137  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.55 
 
 
419 aa  137  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.29 
 
 
250 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.98 
 
 
426 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  24.27 
 
 
470 aa  136  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.06 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  37.19 
 
 
513 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.9 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3418  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.27 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  26.91 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.11 
 
 
478 aa  135  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.7 
 
 
521 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  26.67 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18271  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.7 
 
 
283 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1888  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.47 
 
 
293 aa  133  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1324  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.33 
 
 
309 aa  134  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3547  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.09 
 
 
485 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.00205228  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.97 
 
 
472 aa  133  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.46 
 
 
482 aa  133  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3223  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.41 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2282  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  33.33 
 
 
264 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  35.5 
 
 
490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.05 
 
 
504 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.96 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>