More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06320 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06320  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  438  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0698113  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04200  expressed protein  91.96 
 
 
224 aa  422  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05970  cytosine deaminase, putative  35.25 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  36.94 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  31.97 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  33.68 
 
 
141 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.37 
 
 
174 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  30.47 
 
 
158 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.64 
 
 
174 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  38.75 
 
 
147 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.37 
 
 
166 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1476  tRNA-adenosine deaminase  34.62 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.14 
 
 
161 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.97 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  29.46 
 
 
154 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  41.43 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.75 
 
 
165 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  28.97 
 
 
166 aa  59.7  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.79 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  30.1 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  33.96 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  33.65 
 
 
165 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.41 
 
 
171 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  32.32 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  31.82 
 
 
161 aa  58.9  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.78 
 
 
176 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  31.82 
 
 
150 aa  58.2  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.14 
 
 
160 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.36 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  29.84 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0449  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  42.86 
 
 
140 aa  57.4  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.7 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.48 
 
 
147 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 
158 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  33.33 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.51 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.02 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.51 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.57 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.73 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  32.97 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  30.43 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.73 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  32.08 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.19 
 
 
155 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
162 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.39 
 
 
177 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  34.31 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  38.16 
 
 
145 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.43 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  32.69 
 
 
158 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  35.8 
 
 
146 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  33.33 
 
 
153 aa  55.8  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.71 
 
 
160 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13134  hypothetical protein  30.21 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514569  normal  0.202933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.99 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.08 
 
 
148 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.25 
 
 
150 aa  55.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.48 
 
 
190 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.41 
 
 
482 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1956  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.77 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.53 
 
 
164 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.41 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
187 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.41 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.82 
 
 
157 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  34.15 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.72 
 
 
160 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.56 
 
 
145 aa  55.1  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  32.98 
 
 
148 aa  55.1  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
159 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  33.33 
 
 
148 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 
159 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  33.33 
 
 
148 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 
159 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.46 
 
 
143 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 
159 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.69 
 
 
159 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  34.15 
 
 
182 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  30.1 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.57 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.63 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.18 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  31.65 
 
 
177 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.57 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  32.14 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.27 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  33.33 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.73 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.66 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  27.64 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.63 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.18 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.17 
 
 
166 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  34.94 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.18 
 
 
143 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.63 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>