152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01030 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND01030  conserved hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  751    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02140  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 
515 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.044229  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  32.02 
 
 
414 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  33.47 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.67 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  31.82 
 
 
369 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.55 
 
 
393 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  30.53 
 
 
358 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  34.33 
 
 
371 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
332 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
372 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  28.18 
 
 
388 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  31.96 
 
 
362 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  32.71 
 
 
372 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  32.71 
 
 
372 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  32.71 
 
 
372 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  31.22 
 
 
367 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.22 
 
 
362 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  34.55 
 
 
372 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  30.68 
 
 
371 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  30.17 
 
 
363 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  29.96 
 
 
383 aa  99.8  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  27.69 
 
 
358 aa  99.4  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  28.85 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.05 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  28.31 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
342 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.13 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  28.31 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.67 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  27.07 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  28.19 
 
 
320 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  30.08 
 
 
374 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  30.08 
 
 
374 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  27.31 
 
 
320 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.11 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  27.31 
 
 
377 aa  95.9  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.31 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  32.31 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  32.12 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.67 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  28.31 
 
 
363 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  29.27 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  28.31 
 
 
376 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  33.18 
 
 
396 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  27.35 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  29.22 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  29.22 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  28.05 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.41 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.91 
 
 
419 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  28.77 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  27.15 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  27.15 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  27.15 
 
 
320 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.77 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  27.27 
 
 
351 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.77 
 
 
374 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.22 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.45 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  30.49 
 
 
403 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  28.32 
 
 
358 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  30.91 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  27.16 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  25.2 
 
 
320 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  25.61 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  27.4 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  27.03 
 
 
336 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  23.83 
 
 
361 aa  86.3  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  26.24 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  35.06 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.91 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  27.31 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  26.36 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  30.59 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  26.91 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  27.04 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  29.02 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  30.49 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  26.47 
 
 
248 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  30.63 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  30.63 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  24.22 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.31 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  24.2 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  24.91 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  25.82 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  30.77 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  34.88 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.81 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  34.88 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2464  outer membrane protein  33.93 
 
 
159 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>