237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06880 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA06880  uracil DNA N-glycosylase, putative  100 
 
 
362 aa  746    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07435  uracil-DNA glycosylase (Eurofung)  53.06 
 
 
414 aa  264  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.505373 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  51.33 
 
 
229 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  51.33 
 
 
229 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  51.33 
 
 
229 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  51.33 
 
 
229 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  50.88 
 
 
229 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  50.88 
 
 
229 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  50.88 
 
 
229 aa  229  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  50.88 
 
 
229 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 
229 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  50.88 
 
 
229 aa  225  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 
229 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 
229 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 
229 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 
229 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
229 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
221 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  47.21 
 
 
224 aa  222  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  47.86 
 
 
244 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  46.85 
 
 
225 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 
231 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 
231 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 
232 aa  216  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 
225 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  46.55 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 
218 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  46.54 
 
 
219 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  46.54 
 
 
219 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  48.23 
 
 
228 aa  212  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  46.61 
 
 
220 aa  212  9e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 
221 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
221 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  46.55 
 
 
233 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  48.23 
 
 
228 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  48.67 
 
 
227 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 
221 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  48.84 
 
 
222 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  49.34 
 
 
229 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  48.67 
 
 
230 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
226 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 
221 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  49.27 
 
 
221 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  47.69 
 
 
222 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  46.9 
 
 
228 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  46.46 
 
 
228 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  48.31 
 
 
221 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  48.54 
 
 
221 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  48.23 
 
 
230 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 
221 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  46.36 
 
 
240 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  45.3 
 
 
226 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  47.19 
 
 
241 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 
226 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 
221 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  48.65 
 
 
221 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  45.1 
 
 
261 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 
230 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  44.78 
 
 
225 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  47.19 
 
 
233 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  47.41 
 
 
269 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  43.35 
 
 
224 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  43.64 
 
 
225 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  44.93 
 
 
222 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  43.28 
 
 
231 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 
230 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  46.02 
 
 
225 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  42.44 
 
 
231 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  42.06 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  46.72 
 
 
243 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  42.44 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  47.51 
 
 
218 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  47.39 
 
 
222 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  44.29 
 
 
225 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42190  predicted protein  42.53 
 
 
273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.965691  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  45.81 
 
 
230 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  46.51 
 
 
226 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  44.98 
 
 
219 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  47.51 
 
 
221 aa  199  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 
216 aa  199  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  42.42 
 
 
226 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  45.18 
 
 
245 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  45.11 
 
 
222 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 
224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  43.84 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  44.49 
 
 
222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  46.33 
 
 
222 aa  196  6e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  42.8 
 
 
232 aa  196  6e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  43.86 
 
 
218 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  46.45 
 
 
220 aa  195  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  43.36 
 
 
225 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 
223 aa  194  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  45.02 
 
 
229 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  45.81 
 
 
223 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  47.34 
 
 
228 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  47.34 
 
 
228 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  47.34 
 
 
228 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  43.35 
 
 
223 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>