132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1063 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1063  fatty-acid desaturase  100 
 
 		 352 aa  732    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301867  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5153  fatty acid desaturase  58.79 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2985  fatty acid desaturase  60.28 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  25.58 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.44 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  22.11 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.1 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  27.12 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.34 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  24.91 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0909  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.34 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  24.24 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  24.24 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.74 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.64 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  24.02 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  25.78 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  24.81 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  24.61 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  26.03 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  24.22 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  23.97 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.21 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.74 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  25.5 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0141  fatty acid desaturase  41.51 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  23.71 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  23.71 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.47 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.24 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  23.05 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  24.73 
 
 		 272 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.87 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  27.63 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.41 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  25.09 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  25.94 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  25.56 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  25.49 
 
 		 393 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  23.99 
 
 		 398 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.14 
 
 		 278 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  26.56 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.3 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  23.41 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  25.19 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.02 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  22.31 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  23.74 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  22.76 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  22.71 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  23.51 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1482  stearoyl-CoA 9-desaturase  44.83 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  23.16 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  22.76 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  24.71 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  23.16 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1957  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.13 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0747957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.3 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  23.72 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  23.19 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  25.71 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5325  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  25.4 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  22.63 
 
 		 398 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  22.63 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2228  fatty acid desaturase  39.56 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189769  normal  0.0932296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  23.81 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  24.06 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  22.27 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.27 
 
 		 321 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  25.53 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  24.44 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  26.16 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  23.74 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  22.26 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  23.79 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  24.17 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  24.17 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  21.69 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  22.88 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  21.69 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  22.96 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  22.87 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>