140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2985 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2985  fatty acid desaturase  100 
 
 		 359 aa  746    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1063  fatty-acid desaturase  60.28 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301867  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5153  fatty acid desaturase  54.83 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.27 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3156  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.1 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.52 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  27.71 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  26.9 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  27.16 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0909  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.02 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.18 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.99 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  29.46 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.75 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  24.3 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  27.31 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.62 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.27 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.33 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.78 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.4 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  26.15 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.71 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2615  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.22 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4191  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.57 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0555236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.29 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  27.07 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  25.86 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  26.32 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.67 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28951  Fatty acid desaturase, type 1  25.87 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  23.95 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  26.34 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.03 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.9 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5325  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  24.37 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.27 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.56 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.6 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  25.95 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  24.92 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  26.36 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  26.36 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  23.05 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8609  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.65 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  25.41 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.63 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  24.48 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  23.12 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.14 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  22.5 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25.57 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4186  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.31 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0413  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.57 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.5 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.22 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.06 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0995  Stearoyl-CoA 9-desaturase  24.04 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  23.87 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  23.44 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  23.44 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.47 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  26.5 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1959  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25.69 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000202023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  21.84 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8743  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.51 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  24.43 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  22.96 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1957  Stearoyl-CoA 9-desaturase  24.43 
 
 		 316 aa  53.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0747957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  25.94 
 
 		 412 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  25 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  25 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.58 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  23.55 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  26.77 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2131  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.9 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1717  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  35.9 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  22.76 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3991  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.24 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  22.63 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.44 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  23.19 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2221  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.65 
 
 		 287 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.309276  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  25.41 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  25.41 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  22.69 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  24.37 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  20.14 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  24.79 
 
 		 403 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  23.6 
 
 		 403 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  31.07 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  22.88 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  22.3 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  24.15 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  24.31 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>